Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uba52P62984 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uba52P62984 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms