Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms