Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga11P61622 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms