Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Senp1P59110 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Senp1P59110 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Senp1P59110 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Senp1P59110 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Senp1P59110 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Senp1P59110 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms