Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dpf3P58269 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dpf3P58269 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms