Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms