Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms