Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
StomP54116 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
StomP54116 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
StomP54116 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
StomP54116 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
StomP54116 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
StomP54116 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
StomP54116 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms