Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms