Protein–RNA interactions for Protein: P47937

Tacr3, Neuromedin-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr3P47937 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr3P47937 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms