Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox7P40646 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms