Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TfamP40630 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TfamP40630 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TfamP40630 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TfamP40630 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TfamP40630 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TfamP40630 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms