Protein–RNA interactions for Protein: P31648

Slc6a1, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a1P31648 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a1P31648 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms