Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RxraP28700 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RxraP28700 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RxraP28700 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RxraP28700 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RxraP28700 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RxraP28700 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxraP28700 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms