Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms