Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd247P24161 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms