Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms