Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ggta1P23336 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ggta1P23336 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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