Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd3eP22646 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd3eP22646 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd3eP22646 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd3eP22646 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd3eP22646 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd3eP22646 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd3eP22646 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eP22646 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eP22646 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eP22646 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eP22646 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eP22646 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms