Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cst3P21460 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cst3P21460 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms