Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn1s1P19228 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms