Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms