Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb1P13372 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb1P13372 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms