Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp28P10078 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp28P10078 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms