Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem254bP0DN90 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem254bP0DN90 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms