Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa9P09631 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms