Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna9P09235 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms