Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb7P09024 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms