Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06323 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06323 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06323 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06323 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06323 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06323 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06323 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06323 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06323 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06323 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06323 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06323 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P06323 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P06323 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P06323 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P06323 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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