Protein–RNA interactions for Protein: P01795

Ig heavy chain V region M167, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01795 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01795 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01795 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01795 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01795 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01795 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01795 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01795 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01795 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01795 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01795 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01795 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms