Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ccl20O89093 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl20O89093 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ccl20O89093 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ccl20O89093 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl20O89093 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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