Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng2O88602 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng2O88602 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms