Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntfrO88507 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntfrO88507 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms