Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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