Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lnx1O70263 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms