Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16O54909 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms