Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DffbO54788 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DffbO54788 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DffbO54788 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffbO54788 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffbO54788 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms