Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms