Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Timm44O35857 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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Timm44O35857 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Timm44O35857 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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Timm44O35857 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Timm44O35857 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Timm44O35857 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Timm44O35857 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Timm44O35857 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Timm44O35857 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Timm44O35857 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Timm44O35857 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms