Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casq1O09165 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Casq1O09165 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Casq1O09165 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Casq1O09165 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq1O09165 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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