Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eftud2O08810 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eftud2O08810 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms