Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5849J3QPE5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5849J3QPE5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms