Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm21797J3QNW5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm21797J3QNW5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21797J3QNW5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm21797J3QNW5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm21797J3QNW5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm21797J3QNW5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm21797J3QNW5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm21797J3QNW5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm21797J3QNW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21797J3QNW5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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