Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn20G5E8X0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms