Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms