Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hmgxb3G3X9M3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hmgxb3G3X9M3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hmgxb3G3X9M3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgxb3G3X9M3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms