Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zkscan2G3X952 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zkscan2G3X952 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms