Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf6F6VAN0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf6F6VAN0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms