Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933403O08RikF6UK53 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms