Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28305F6U473 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28305F6U473 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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